Aspera下载NCBI和EBI文件---生信编程日常

Aspera下载和安装

Aspera下载: http://downloads.asperasoft.com/connect2/。

wget http://d3gcli72yxqn2z.clo…

python中的if x 与if x == True---生信编程日常

如题目,假设x = True,那么这两者的运行速度如何呢?
test1.py:

x = True
if x:
pass

test2.py:

x = True
if x …

明码标价,暗网真可雇凶杀人?学术界首次直面“杀手”问题---大数据文摘

编译:马莉、刘俊寰

漆黑房间角落,黑衣人通过泛着微光的手机收到了行动指令,收定金-准备装备-刺杀一气呵成,这是《这个杀手不太冷》一类杀手篇中的经典接头镜头。

多年以来,由…

下载ENA数据库文件---生信编程日常

ENA数据库:European Nucleotide Archive:隶属EBI (European Bioinformatics Institute),由 EBI 负责维护,优点是可以下载fa…

为什么在python中for-range比while运行的要快---生信编程日常

while的代码test1.py:

i = 0
while i < 10000000:
i += 1

for-loop的代码test2.py:

for n in ran…

挑战马斯克Neuralink!斯坦福全新脑机接口,直连大脑和硅基芯片---新智元

新智元报道

来源:stanford

编辑:白峰、鹏飞

【新智元导读】最近,斯坦福大学的研究人员开发出一种新的脑机接口设备,可以将大脑直接与硅基技术连接起来。 虽然脑机接口设…

桑基图---生信编程日常

桑基图(Sankey diagram),即桑基能量分流图,也叫桑基能量平衡图。它是一种特定类型的流程图,图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小,通常应用于能源、材料成分、金融等数据的可视化分析…

itertools.islice的用法---生信编程日常

itertools.islice的基本用法为:
itertools.islice(iterable, start, stop[, step])
可以返回从迭代器中的start位置到stop位…

除了从交易大厅看美股熔断,遥感图片也能看出疫情对经济的影响---大数据文摘

编译:徐玲

疫情之下的交易员们,并不好过,10天之内美股共发生了4次熔断!

3月16日,美股遭遇黑色星期一,道指、纳指和标普500暴跌11%以上,触发本月第三次熔断;3月…

limma做RNAseq差异分析---生信编程日常

limma是一个很强大的用于分析芯片的R包,也可以用于RNA-Seq的差异分析
以两个组比较为例:首先输入count表达矩阵,这里也跟其他差异分析R包一样,不要输入已经标准化的数据。
本文主…

rsync快速删除大量小文件---生信编程日常

有时候一个文件中有几十万个甚至更多子文件的情况下,就算这个文件不大,可能只有几G的情况下,用rm -rf 仍然很慢,需要等很久,而且占用大量的系统资源。一个比较快速的方法是用rsync同步。

monocle 2拟时序分析---生信编程日常

monocle做拟时序分析首先要构建CDS需要3个矩阵:expr.matrix、pd、fd,其次将Seurat中的对象转换为monocle识别的对象。然后选择想要做拟时序依据的基因就可以了,如果…

IBM、微软联合白宫部署超级计算机,对抗冠状病毒---大数据文摘

编译:牛婉杨

在中国疫情爆发时期,我国同众多科技公司一起抗击病毒,效果显著。现在,轮到美国了。

3月22日,特朗普政府表示,IBM正在与白宫合作,提供大量的超级计算能力,…

MacOS与Linux中sed的不同---生信编程日常

在两个环境中看sed的命令,可以发现返回的并不相同:

Linux环境中:

linux

MacOS环境中:

MacOs

其二个显示的是所…

R读写xlsx文件---生信编程日常

读取xlsx文件可以用xlsx 包,但是因为xlsx依赖java很容易出现各种问题,有时会爆内存而且速度较慢。因此可用其他包代替。
推荐readxl的read_excel,兼容.xls 和 .…