使用作者代码重复结果---生信技能树jimmy
瞎采新闻 发布于 2020-03-30 序言
第三单元第十二+十三讲：使用作者代码重复结果
课程链接在：http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/detail.html?cid=53
这一篇会…
动态实例分割SOLOv2，更快更强更精准！---CV君
瞎采新闻 发布于 2020-03-30 今天跟大家分享下前天新出的论文 SOLOv2: Dynamic, Faster and Stronger，一看这名字就知道很霸气！SOLO 超越自己，在原有架构基础上引入动态卷积和发明了Matrix …
如何去学一个R包（下）---生信技能树jimmy
瞎采新闻 发布于 2020-03-30 回顾
如何去学一个R包（上）
检查伪时间基因表达的变化FateID还提供伪时间基因表达变化的可视化和分析功能。为此，可以提取具有朝向目标簇的命运偏差的细胞。princip…
如何去学一个R包（上）---生信技能树jimmy
瞎采新闻 发布于 2020-03-30 序言
FateID是用于定量单细胞转录组数据集中细胞命运偏倚的方法，所述数据集包含从共同祖先（Herman，Sagar和 Grün2018）产生的不同细胞类型。预期祖先群体是数据集的…
旷视提出Circle Loss，革新深度特征学习范式 ｜CVPR 2020 Oral---CV君
瞎采新闻 发布于 2020-03-30 本文提出用于深度特征学习的Circle Loss，从相似性对优化角度正式统一了两种基本学习范式（分类学习和样本对学习）下的损失函数。通过进一步泛化，Circle Loss 获得了更灵活的优化途径及更明…
使用monocle2分析文章数据---生信技能树jimmy
瞎采新闻 发布于 2020-03-30 前言
第三单元第十一讲：使用monocle2分析文章数据
课程链接在：http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/detail.html?cid=53<…
是否可以根据10X转录组数据来推断基因组CNV信息呢？---生信技能树jimmy
瞎采新闻 发布于 2020-03-30 有学员问10x的3‘端测序来infer CNV 是否可靠？
这个问题，说实话，很难回答，因为要是能完整回答这个问题，其实就是一篇正经的生物信息学文章了。
而且以前的确有文…
「面试心理学」面试前的思考---童欧巴
瞎采新闻 发布于 2020-03-30 口味：乾隆白菜
烹饪时间：15min
面试是一直火热并广受大家关注的话题，社区内不断输出着丰富的面试题以及各大厂面经，以题目为主，经验为辅。但其实在整个面试环节中重要…
你以为细胞聚在一起就是一类细胞吗---生信技能树jimmy
瞎采新闻 发布于 2020-03-30 我一直强调过，所谓的单细胞数据分析，其实就5个R包，分别是: scater,monocle,Seurat,scran,M3Drop 需要熟练掌握它们的对象，：一些单细胞转录组R包的对象 分析流…
单细胞转录组的CNV可以区分细胞恶性与否---生信技能树jimmy
瞎采新闻 发布于 2020-03-30 对单细胞转录组数据计算基因组层面的CNV信息，这个概念最早来自于Aviv Regev实验室，在她的一系列文章里面得到了淋漓尽致的展示。
Aviv Regev；早年在以色列的特拉维夫大…
漫画：二叉树系列 第八讲（二叉树的剪枝）---程序员小浩
瞎采新闻 发布于 2020-03-30 在之前的系列中。我们学习了DFS、BFS，也熟悉了平衡二叉树，满二叉树，完全二叉树，BST（二叉搜索树）等概念。在本节中，我们将学习一种二叉树中常用的操作 -- 剪枝。这里额外说一点，就本人而言…
漫画：二叉树系列 第七讲（完全二叉树的节点个数）---程序员小浩
瞎采新闻 发布于 2020-03-30 在上一篇中，我们学习了解了平衡二叉树，并且利用DFS进行了验证。在本节中，我们将继续学习完全二叉树的相关内容。首先了解一下什么是完全二叉树。
01
完全二叉树
nature文章也要挖掘单细胞公共数据---生信技能树jimmy
瞎采新闻 发布于 2020-03-30 我列过一个生物信息学入门200篇NGS文献解读计划，其中一个文献是发表于2018的NC，标题是：Unravelling subclonal heterogeneity and aggressiv…
乳腺癌转移过程中的异常发育途径---生信技能树jimmy
瞎采新闻 发布于 2020-03-30 当你的才华还撑不起你的野心时，请潜下心来，脚踏实地，跟着我们慢慢进步。不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了，通过文献速递这个栏目很幸运聚集了一些小伙伴携手共进，一起成长。
…
sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程：整合分析---生信技能树jimmy
瞎采新闻 发布于 2020-03-30 如果只是做单个样本的sc-RNA-seq数据分析，并不能体会到Seurat的强大，因为Seurat天生为整合而生。
本教程展示的是两个pbmc数据（受刺激组和对照组）整合分析策略，…