windbg语法规则---franket
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自己简要翻译了下:
When you are debugging, you…产品资讯 | 腾讯优图推出人脸年龄变换技术:母亲节带着妈妈一起重返十八岁!---优图实验室
母亲节,你打算送给妈妈什么礼物?不如带着妈妈穿梭时光,回归少女时代!5月10日,腾讯优图、腾讯新闻、腾讯云神图联合推出母亲节主题活动“带着妈妈重返花样年华”,借助腾讯优图的人脸年龄变换技术,让妈…
nginx proxy_set_header配置覆盖---fanspring
问题
当使用nginx反代时候我们经常会使用proxy_set_header来设置http头,如下面是一个常用的配置。
server {listen 8080;
…
Druid源码阅读(二):Druid Segment存储格式---2011aad
一、Druid Segment介绍
Druid流数据摄入后会以Index形式保存在内存中,同时会定期将Index序列化成Segment文件持久化到可靠存储中(如HDFS),批数据摄入会直接通过离线…
ChAMP 分析甲基化芯片数据-归一化篇---生信修炼手册
champ.norm 函数提供了归一化的功能,支持下列4种归一化的算法:
BMIQPBCSWANFunctionalNormalization其中BMIQ和PBC 算法都是只针对探针…
ChAMP分析甲基化芯片数据-差异分析上篇---生信修炼手册
经过预处理之后的数据,就可以进行差异分析了。对于甲基化芯片而言,有两个方面的差异分析
DMP 差异甲基化探针DMR 差异甲基化区域在ChAMP包中,champ.DMP函数用于分析差异…
ChAMP 分析甲基化芯片数据-差异分析下篇---生信修炼手册
对于甲基化芯片的差异分析,除了有探针水平的差异分析,还有差异甲基化区域DMR分析。
差异甲基化区域的示意图如下:
该图片来自Bumphunter的文献,图中绿色矩形代表的…
ChAMP分析甲基化芯片数据-GSEA篇---生信修炼手册
当我们得到差异的探针或者差异的甲基化区域之后,通常都会分析这些差异区域对应的基因是否在特定功能上有富集。在ChAMP中,通过champ.GSEA函数来实现功能富集分析。
用法示例:<…
ChAMP 分析甲基化芯片数据-EpiMod篇---生信修炼手册
DNA甲基化会调控基因的表达水平,进而影响基因的相互作用。将基因的相互作用网络和差异甲基化信息结合起来,基于那些甲基化水平发生差异的基因,从整个相互作用网络挖掘出这些基因的相互作用模块,这些模块…
bismark对参考基因组建立索引---生信修炼手册
分析DNA甲基化的手段有很多,除了甲基化芯片外,还有WGBS和RRBS等实验与高通量测序相结合的手段,不管是哪种策略,都需要对DNA进行亚硫酸氢盐处理。
在WGBS和RRBS的分析过…
bismark 识别甲基化位点-比对篇---生信修炼手册
bismark 软件根据序列的比对情况就可以识别甲基化位点,首先需要对基因组建立索引,建好索引之后,就可以开始比对了。
我用的软件自带的单端测序的数据集进行测试, 命令如下
…methylKit 进行差异甲基化分析---生信修炼手册
methylKit 是一个用于分析甲基化测序数据的R包,不仅支持WGBS,RRBS和目的区域甲基化测序,还支持oxBS-sq, TAB-seq等分析5hmc的数据。 其核心功能是差异甲基化分析和…
DiseaseMeth 人类疾病相关的甲基化信息数据库---生信修炼手册
DNA甲基化作为表观遗传的一种标记,在生长发育和疾病发生过程中扮演着重要角色。随着大规模甲基化研究的进行,积累了大量疾病相关的甲基化数据,DiseaseMeth就是一个保存了人类疾病相关的甲基化…
circos 可视化手册-histograms篇---生信修炼手册
histograms可以看做是line plot的一个变种,首先来看一个示例
图中最内圈的就是historgams了,可以看到由许多个柱子组成,每个柱子都是file中定义的一个区域…
circos 可视化手册-tile 篇---生信修炼手册
tile用来展示基因组上区域的分布,和之前介绍过的highlight不同,这些区域在图中并不是位于同一层的。为了避免不同区域之间的重叠,tile会将有重叠的区域分布在不同的层,结合图片来理解一下…
