circos 可视化手册- heatmap 篇---生信修炼手册
瞎采新闻 发布于 2020-05-10 heatmap将一系列的数值映射到一个颜色梯度中，是最常用的图表之一。在circos中，通过plot这个block进行设置。
用法如下：
heatmap的数据和scatt…
腾讯Elasticsearch海量规模背后的内核优化剖析---huanghua
瞎采新闻 发布于 2020-05-09 背景
Elasticsearch 在腾讯内部广泛应用于日志实时分析、结构化数据分析、全文检索等场景，目前单集群规模达到千级节点、万亿级吞吐，同时腾讯联合 Elastic 公司在腾讯云上提供了内核增…
基于硬件防御恶意软件的检测器抵御对抗性攻击（CS CR）---刘持诚
瞎采新闻 发布于 2020-05-09 基于硬件防御恶意软件的检测器抵御对抗性攻击（CS CR）
在物联网时代，过去十年来，恶意软件呈指数级增长。传统反病毒软件对现代复杂的恶意软件的打击效果不佳。为了应对这一挑战，研究人员…
用于多变量数据分类的局部级联集成（CS LG）---刘持诚
瞎采新闻 发布于 2020-05-09 我们提出了 LCE，一种用于传统（表格式）多变量数据分类的局部级联集成（LCE）及其扩展的用于多变量时间序列（MTS）分类的 LCEM。LCE 是一种新的混合集成方法，它结合了显式升压-袋式方法…
Plan2Vec: 基于潜在计划的无监督表示学习（CS LG）---刘持诚
瞎采新闻 发布于 2020-05-09 在本文中，我们介绍了 Plan2Vec，一种无监督表示学习方法，它的灵感来自于强化学习。Plan2Vec 使用近邻距离在图像数据集上构建一个加权图，然后通过提炼在计划路径上的路径积分，将这个局部…
记一个rw_semaphore导致的系统hung问题分析---用户4645686
瞎采新闻 发布于 2020-05-09 该问题发生于centos7内核3.10.0-693.1.1.el7.x86_64，源码部分分析也来自该版本内核。
一、机器重启后拿到kernel coredump第一件…
bismark 识别甲基化位点---生信修炼手册
瞎采新闻 发布于 2020-05-09 在bismark中，根据甲基化的C所处的上下文环境，分成以下3类；
CpGCHGCHHp代表磷酸二酯键，CpG指的是甲基化的C的下游是1个G碱基。H代表除了G碱基之外的其他碱基，即A…
bismark 识别甲基化位点-可视化篇---生信修炼手册
瞎采新闻 发布于 2020-05-09 在bismark中提供了两种生成html报告的方式，对应两个命令
bismark2reportbismark2summary第一个命令针对单个样本。每个样本在比对之后，都会生成一个r…
bsseq 进行差异甲基化分析---生信修炼手册
瞎采新闻 发布于 2020-05-09 bsseq 主要用来分析WGBS的数据, 安装过程如下
source(“http://bioconductor.org/biocLite.R“)
biocLite(“bsseq”)<…
PubMeth: 癌症相关的甲基化基因数据库---生信修炼手册
瞎采新闻 发布于 2020-05-09 在DNA甲基化与疾病的研究中，最常见的一个问题就是，是否有已经发表的文献表明某个基因在某种疾病中发生了甲基化。回答这样的问题，需要大量的文件检索工作。
PubMeth 收集和整理了文…
iMETHYL : 整合了DNA甲基化, SNP和RNA_seq的多组学联合数据库---生信修炼手册
瞎采新闻 发布于 2020-05-09 在NGS飞速发展的时代，有大量研究通过GSWA的方法，阐述了SNP于疾病之间的关联; 也有学者利用WGBS，RRBS, 甲基化芯片等方式研究DNA甲基化与疾病之间的关系。不过是对于SNP和DNA…
circos 中的pattern是做什么用的---生信修炼手册
瞎采新闻 发布于 2020-05-09 在官网提供的配置文件示例中，经常会见到pattern这个参数。这个参数的作用和fill_color类似，都用于指定填充的样式，只不过fill_color使用颜色进行填充，pattern则用点和线…
circos 可视化手册- zooms 篇---生信修炼手册
瞎采新闻 发布于 2020-05-09 在展示染色体信息时，如果想要重点展示其中某一段区域的信息，可以借助zooms来实现。zooms起到一个伸缩的功能，将原本的区域放大或者缩小。
配置文件写法如下：
zoom…
circos绘制彩色的links---生信修炼手册
瞎采新闻 发布于 2020-05-09 对于links而言，默认情况下所有的links 都是同一种颜色，通过color属性指定。当我们想要构建出彩色的links 时，通常情况下有3种做法:
1. 拆分file每一个link…
circos 可视化手册- images 篇---生信修炼手册
瞎采新闻 发布于 2020-05-09 image这个block是circos内置的block之一，其配置文件为软件安装目录下的etc/image.conf。内容为
默认的image的配置由两个文件决定
image.…